半夜，此时已经夜深人静，毛利小五郎他们所住旅馆内，唐震正在听着毛利小五郎的梦话百无聊赖的守夜。
突然，唐震发现一道黑影悄悄的慢慢接近，唐来到毛利小五郎身前，先是用手捂住了他的嘴，然后悄悄把他叫醒。
“毛利叔叔醒醒！”
“唔！怎么样了？”看着清醒的毛利小五郎，唐震用手指了指门外。
“这……”看见这道黑影，毛利小五郎吓了一跳，没想到真被唐震说中了，今夜会有人来杀他们。
“砰”就在黑影刚刚开门的时候，唐震一脚踢了过去，直接将黑影踢飞。
“混蛋，站住！”黑影被踢飞以后，落在地上，一个翻身就开始往外跑，而毛利小五郎忍着屁股上的疼痛，已经追了上去。
“毛利叔叔等等！”唐震也赶忙跟着追了出去？
“爸爸，怎么了？”这是睡在里屋的小兰和柯南你被两人的动静吵醒，出来时只看见了唐震和毛利小五郎追出去的背影。
唐震和毛利小五郎追着黑影来到幽灵船的地方，就失去了踪迹。
“走！我们进去看看。”
“大叔！先等一下，这黑灯瞎火的，万一有危险怎么办？”唐震拉住了有些冲动的毛利小五郎，劝道，“这么大的动静，一会儿等人到齐了，一起进去。”
“你这也太小心了吧。”毛利小五郎有些无语，但还是忍住了进去的冲动。
不多时，因为听到动静被吵的三上村长就带着一群人来到了这里。
“毛利先生，听说有人袭击了你们，这是怎么回事？”三上村长对毛利小五郎问道。
“我还想问怎么回事呢？白天我差点就被人害死，晚上又有人来袭击，你问我，我又问谁去？”毛利小五郎有些不满的抱怨说道。
“啊！那有抓住那个人吗？”
“没有，那个人跑进了这家仓库里面，因为黑灯瞎火的，万一有埋伏怎么办，我们就没有进去。”毛利小五郎摇了摇头。
一行人来到仓库里面，却在神龙号发现了一具尸体。
“大家让一让，不要破坏了现场。”这时毛利小五郎这个侦探起到了作用，他上前检查了一下看起来有些凄惨的尸体，“死者生前受到很大的折磨，你们有时认识他是什么？”
“啊！这是宾田……”有人认出了死者，那是码头灯塔的看守。
“啊！这是海军在作祟。”有人发出了凄惨的叫声，引起了其他人的恐惧。
“都是你们这些外来人的到来，才引起了海军灵魂的暴动。”
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“再这样下去，海军灵魂会诅咒我们的，把他们赶出去。”
开始有人把责任推到了海军灵魂的身上，同时责怪起毛利小五郎他们这一行人来，想让他们一行人赶出去。
“喂喂！是你们自己请我来的，好不好？”毛利小五郎发怒了，一上岛就就遇见这么多糟心事，现在还怪起他们来了。
“那个，大家冷静一下，今天下午我好像看见这个死者，和那个东京旅行社来的上原有过冲突，而且他身上好像还带有武器。”这时唐震说了今天自己看到了一幕。
“哦！你是说那个上原！”三上村长对身边的人问道，“你们有谁知道上原住在哪儿？”
“好像是住在田边旅馆！”
“好！现在就去找他问问情况。”
“知道了。”
留下一些人在这里看着宾田的尸体，刚刚赶来的一个警察，和村民组成的自卫队一起赶往了田边旅馆。
这时唐震发现了人群里有些不太正常的木下老头儿，只是他没有说出来而已。
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“木下伯伯！”这时一直没有出声的柯南对木下老头问道，“他们说的海军灵魂是怎么一回事啊？”
“这个嘛！”木下老头儿目光在唐震身上顿了顿说道，“这还得从四百多年前说起，当时有一只战败的海军逃到了这里，没想到这个岛上的居民会因为觊觎海军身上带的那些财宝，最后对那些海军发起了攻击，让他们杀死在那一个洞穴里面。”
“从那以后，岛上就有很多奇怪的事情发生，大家认为那是海军灵魂在作祟，为了平复他们的怒火，早上的村民在海军死亡的洞穴里面安下了神位，这样早上才安静下来。”
“可这些都是四百多年前的事情了，为什么村民还这样害怕。”柯南继续追问道。
“因为五年前同样有一批人来研究海军，但是他们最后无缘无故的消失了。”
“啊！那海军洞穴在哪里？”柯南之前就听唐震说过岛上有失踪过一群人，没想到是来研究海军的，最后他问了一下那个海军洞穴的位置在哪里？
“啊！这个可不能告诉你。”说话间大家已经来到了田边旅馆。
“让我先进去吧？他是我请来的，我想劝一劝他自首。”就在大家准备进去的时候，木下老头儿对大家说道。
说完老头儿不顾大家的反对，就直接走进了旅馆里面，看这情况大家只好无奈的等在了外面。
想偷偷遛进去的柯南也被大家拦了下来。
大概过了四五分钟的模样，里面突然传来了一声枪声。
“不好！”听到枪响，一群人直接冲了进去，就看到木下老头，捂着一条臂膀痛苦的倒在地上。
“木下先生！你没事吧？”
“我没事，只是一些擦伤而已。”木下指着打开的木窗，“我本来是想劝他自首的，没想到他却直接对我开了枪，然后就从这里逃走了。”
大家来到窗口向外看去，就看到一道黑影逃进了森林里面。
留下一个人送木下老头儿去医院，其他人都追了出去，只是最后寻找了半天，黑灯瞎火的，什么也没有发现。
回到住宿的旅馆的路上。
“唐震哥哥！你有没有发现木下伯伯手上枪伤有问题。”柯南来到唐震身边问道。
“嗯！我注意到了，那应该是他自己打上去的，而且他好像就是之前去袭击我们的那个人。”唐震说出了自己的推测。
“哦！你有什么证据吗？”
“没有！我只是感觉到他身上有伤而已，之前来袭击我们的人，被我踢了一脚。”